医疗污水向自然环境或城市管道排放的污水。其水质随不同的医疗性质、规模和其所在地区而异。每张病床每天排放的污水量约为200-1000L。医疗的污水，除一般生活污水外，还含有化学物质、放射性废水和病原体。
因此，必须经过处理后才能排放，特别是肝炎等传染病病房排出来的污水，须经消毒后才可排放。无集中式的医疗污水处理设备，对有传染性的粪便，必须单独消毒使其无害化。常用消毒剂有漂白粉、、次氯酸钠、臭氧。
对含放射性同位素的污水，应按同位素处理要求处理。医疗污水在处理过程中，沉淀的污泥含有大量的细菌、病毒和寄生虫卵，须经消毒（常用熟石灰消毒）或高温堆肥后方可用作肥料。
医疗污水处理不达标一直是危害环境的重要因素。经过有关部门长期调查研究显现医疗污水处理不主要有下列因素：
1.分类废水所使用药剂为了减低成本都是有很强针对性。从而造成各分类废水处理良好，综合水还是处理不达标。
2.为水质清澈和降低成本使用大量石灰。但是却产生大量污泥，往往废水处理成本中30%---40%是处理污泥所产生。
3.来水PH值变化大，反应池PH控制不稳定。PH不稳定造成沉淀池浑浊。出水水质也跟着不稳定，时好时坏。
4.水处理人员责任心不强，操作不够细心，不注重细节。比如：来水有问题，不及时停机进行应急处理。各种仪表、探头不经常校正清洗。配制药品浓度不按工艺要求配制，为了省事，私自把浓度提高。
5.表面处理行业的产品进行表面处理前，必须先经过大量的前处理，这其中使用的除油粉里含有乳化剂，而大量的乳化剂不但影响COD的含量，而且影响沉淀池的矾花絮凝，成泥不理想，致使沉淀不好，大量悬浮物跟随上层清水流出沉淀池，在PH回调的时候重新溶解进水里，结果造成排放口重金属离子标。
